Come i motori a pistoni con configurazione a V, i motori a configurazione boxer o flat possono essere fatti circa la metà della lunghezza di un motore a configurazione diritta. Rispetto ai motori a V i boxer non sono così alti, offrendo la possibilità di posizionare la massa più in basso nel telaio del veicolo, ma sono più larghi.
Tutti i motori boxer sono caratterizzati da basse vibrazioni primarie in quanto le coppie di pistoni sono opposte e si muovono in modo da annullare l'uno il momento dell'altro.
Come i Vs. boxer sono più complessi dei motori in linea, avendo 2 teste cilindri con relative guarnizioni di testa, collettori di scarico ecc. e un numero doppio di alberi a camme, catene o cinghie più complesse e un raffreddamento più complesso.
Rispetto ai V, i motori boxer hanno un albero motore più complesso in quanto hanno un tiro di manovella per ogni biella. I veri V hanno coppie di bielle che condividono ogni tiro di manovella.
La probabile ragione per cui i boxer o le configurazioni piatte non sono usati molto spesso nelle auto moderne è perché un motore diritto o a V è quasi sempre una scelta migliore.
Molte auto sono ora a trazione anteriore e funzionano meglio con un motore compatto e montato trasversalmente. Un 4 cilindri in linea o un V6 sono molto più adatti di un 4 o 6 cilindri in questa configurazione.
I motori montati longitudinalmente sono preferiti per il motore anteriore e la trazione posteriore, la massa inferiore del motore boxer probabilmente non fornisce un vantaggio sufficiente rispetto al più semplice straight-4 o V6.
Dove i boxer sembrano davvero funzionare è nelle auto con motore posteriore raffreddato ad aria (per esempio, la VW Type-1 e la Porsche 911) dove la larghezza è meno importante, il motore deve essere il più corto possibile per evitare una grande massa dietro l'asse posteriore, e le bancate di cilindri sono più facili da raffreddare perché sono più distanziate tra loro.
Per quanto riguarda il layout moderno della Subaru, che originariamente aveva motori a 4 cilindri e trazione integrale, un boxer montato longitudinalmente ha senso. Per ospitare gli alberi della trazione anteriore, il motore deve essere posizionato davanti alla linea dell'asse anteriore, e il motore boxer corto e basso ha dei vantaggi. (Confrontate questo con l'originale Audi 80 Quatro a trazione integrale che aveva un 5 cilindri in linea che pendeva davanti all'asse anteriore).
A un certo punto i motori flat-12 furono usati in auto da corsa come la Porsche 917 e molte Ferrari F-1 (anche se questi erano tecnicamente dei V-12 a 180°, che possono avere qualsiasi angolo di bancata dei cilindri). I Flat-12 si dimostrarono incompatibili con gli effetti di terra, poiché le teste dei cilindri occupavano lo spazio dove dovevano esserci i tunnel di Venturi.